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親の分子，細胞，個体のものと異なる子孫の分子，細胞，個体の遺伝子組合せ，これは，２本の染色体の間でDNA配列が交換したり，連鎖しない遺伝子の自由な集合，連鎖遺伝子間の交差，シストロン内の交差から生まれる組換え体において遺伝子が新しく結びついたりして生じる．自然界における組換え過程は，組換えDNA技術を用いて，in vitroでDNA鎖の切断と再結合であると解明できた．特定の二つの遺伝子または突然変異点の間で組換えが起こる頻度を組換え頻度といい，この値は遺伝地図の作成に利用される．
