多入出力系の出力をys(s），入力をuj(s），その間の伝達関数をGij(s）とする．このとき，入出力間の関係は\({y_i}\left( s \right) = \sum\limits_{j = 1}^m {{G_{ij}}\left( s \right){u_j}\left( s \right)} \)，i＝1，…r，と表現でき，1入出力系と異なり，出力yi(s)は対応する入力ui(s)以外の多くの入力の影響を受ける．このような任意の入力uj(s)，j≠i，の出力yi(s)に及ぼす影響を干渉またはクロスカップリングという．r＝mの場合にはm×m伝達関数行列（Gij(s))の非対角要素Gij(s)，i≠j，が干渉の定量的程度を示すこととなる．