塩素系薬剤を使用して殺菌消毒することで塩素処理ともいう．代表的な使用薬剤は次亜塩素酸ソーダ，次亜塩素酸カルシウムなどがあるが，不安定なため長時間貯蔵すると効果が薄れる．本処理はオゾン処理より酸化力は劣るが，安価なので広く使われている．