分子内の電子状態を記述する波動関数で，電子は原子核とほかの電子の作るポテンシャルの中を運動（ハートリ・フォック近似，一電子近似）し，その波動関数は一般に分子全体に広がっていると考える．このような一電子の波動関数を分子軌道と呼び，分子軌道を用いて孤立した分子の全電子の波動関数を表す近似を行い原子配置や電子構造を求める方法を分子軌道（MO）法という．化学反応を定量的に扱える利点がある．